EDI模塊可生成少量的氫離子和氫氧根離子，用于模塊中的離子交換樹脂的再生。EDI模塊中生成的高 PH值和低 PH值可在運行過程中將微生物滋生情況控制在非常低的水平。
淡水的電導率和溫度可通過電導率儀(CE3404)持續進行監控。如果淡水的電導率低于設定值，閥門(AV3420、AV3423)打開，淡水流入純水罐。如果電導率高于設定值，閥門 (AV3422)打開而閥門(AV3420、AV3423)關閉。 淡水的流量可以通過流量計(FE3406)測量,濃水的流量通過流量計(FIS3405)測量，流量計(FIS3405)帶有低限位開關，濃水通過流量低于設定值時，便會發出報警而后關閉EDI系統的供電。
當純水箱滿液位后，純水箱中的液位變送器會向控制柜發出信號。閥門(AV3420、AV3423)將關閉，閥門(AV3421)打開，系統以循環模式運行。此時系統循環運行的效率約為正常運行時的70-80%。
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