凍干技術最先應用于軍事醫用領域，如紅細胞、血漿、血清、酶制劑、生物細胞、人體組織等的凍干保存，后來廣泛應用于食品、飲料、保健品以及生物制品的加工。
21世紀，隨著材料領域的迅猛發展，凍干機設備的應用日趨活躍。由生物材料凍干機設備制備的超微粉末功能材料如光導纖維材料、超微粉末材料、微波介質材料、磁粉、催化劑等的應用日趨活躍；生物材料特別是生物醫學材料如微膠囊制備、藥品控釋材料、人體組織材料、生物制劑的真空凍干制備應用不斷增多；同時材料科學、生物科學、生命科學的進一步發展必將帶動凍干技術的發展。
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