因為凍干藥品的要求比較高，醫用級凍干機都是采用原位凍干功能，擱板可以控溫制冷，箱體材質一般采用316不銹鋼，可選CIP在線清洗、SIP在位滅菌功能。
傳統食品凍干機制造技術，由低溫庫、真空干燥機組合而成。產品先在低溫庫凍結，然后真空干燥機控溫脫水（控溫范圍：常溫~120℃）。箱體材質一般采用碳鋼，擱板采用鋁材。優點：降低制造成本；缺點：設備材質使用壽命6年左右，鋁材不滿足現階的食品安全需求，設備技術限制適合低檔食品加工，凍干產品效果一般。
新型食品凍干機技術，借鑒了醫用級凍干機制造技術，箱體采用食品級304不銹鋼材質（使用壽命10年以上），擱板可以控溫制冷，無需配置冷庫。為減低設備成本，結合了傳統食品凍干機技術，采用圓艙箱體。優點：設備穩定、使用壽命長、凍干應用范圍廣。缺點：比傳統冷庫凍干機制造成本稍高。
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